以手术治疗为主，也可结合放射和化学治疗。
①手术治疗
肿瘤小局限于包皮者可仅行包皮环切术。阴茎癌一般需行阴茎部分切除术，至少在癌以上2厘米处切断，如残留阴茎不能站立排尿和性交时，应行阴茎全切除术，尿道移至会阴部。有淋巴结转移者应在原发灶切除后2-6周控制感染后行两侧腹股沟淋巴结清除术。
②放射治疗
早期和年青人阴茎癌可行放射治疗，也有主张阴茎癌先行放射治疗，如失败再行手术。但放射治疗疗效不理想，大剂量时尚可引起尿道瘦、狭窄等。
③化学治疗
博来雷素对阴茎癌有良好疗效，也可用于配合手术和放射治疗。
④局部处理
确诊后应争取早期行阴茎癌切除根治术。初中期可以大豆甘草汤洗涤患处，再用鸭血清调凤衣散敷患处，一日1-2次。后期可用鲜山慈菇捣碎烂外敷；溃烂出血者，掺海浮散，外盖生肌玉红膏。