卫生部对全国30个市和78个县(县级市)进行的统计数据表明，城市居民死亡原因构成中居前10位者分别为：恶性肿瘤、脑血管并心脏并呼吸系统疾并损伤及中毒、消化系统疾并内分泌营养和代谢疾并泌尿生殖系统疾并精神障碍、神经系统疾病，这10种死因合计占总死因的92.03%。农村居民前十位死因分别为：呼吸系统疾并脑血管并恶性肿瘤、心脏并损伤及中毒、消化系统疾并泌尿生殖系统疾并内分泌营养和代谢疾并肺结核、精神障碍。这10种死因占死亡总数的91.9%。

此次统计中，城市和农村居民的疾病谱构成略有不同。卫生部门统计市医院住院患者中，疾病构成前10位分别是呼吸系统疾病，消化系统疾病，损伤、中毒和外因，妊娠、分娩和产褥期病，泌尿生殖系统疾病，恶性肿瘤，脑血管病，传染病和寄生虫病，缺血性心脏病，肌肉骨骼系统和结缔组织玻县医院住院患者疾病构成前10位则分别为损伤、中毒和外因，呼吸系统疾病，妊娠、分娩和产褥期病，消化疾病，脑血管病，泌尿生殖系统疾病，传染病和寄生虫病，围生期病，缺血性心脏病和恶性肿瘤。

中国协和医科大学流行病学教研室黄建始教授指出，死因统计是测量一个国家公民健康状况最重要的手段之一。从卫生部公布的这些数据可以看出，慢性病是我国目前最沉重的疾病负担。在2003年SARS暴发后，国家重视了传染病防御系统建设，但当前国人健康面临的最大挑战仍是慢性疾病，即使是呼吸系统疾病，也是以慢性阻塞性呼吸道疾病为主，而不是传统的肺炎。