存在高频微卫星不稳定性(MSI-H)的结肠癌有独特的临床病理特征，包括预后较好和对含5-FU方案化疗疗效低。Bertagnolli等在2006年ASCO年会上报告了含伊立替康方案辅助治疗MSI-H结肠癌的疗效。

CALGB 89803临床研究随机入组了1264例III期结肠癌术后患者接受5-FU和叶酸(LV)加或不加伊立替康治疗。作者收集了包埋原发肿瘤和正常组织的石蜡组织块。采用一组单核苷酸和二核苷酸标志物检测微卫星不稳定性。中位随访3.8年，在C89803研究中，5-FU/LV 加伊立替康并没有优势。接受临床分析的患者无论有或无肿瘤标本在治疗、年龄、性别、原发肿瘤部位、T分期、肿瘤分化、阳性淋巴结数和粘膜类型上没有差异。在482例进行分析的肿瘤标本中，75 例(16%)肿瘤标本显示MSI-H。MSI-H的肿瘤更常见于近端结肠癌(p<0.0001), 高分级的病理类型(p<0.0001)和粘液腺癌(p<0.0001),以及淋巴结数多的肿瘤(MSI低频和MSI高频的肿瘤平均每个病例的阳性淋巴结数分别是3.5和4.7 =0.04)。在进行临床分析时，482例患者中有143例(36%)患者出现肿瘤复发和/或任何原因的死亡。对于MSI-H的肿瘤来说，接受伊立替康/5FU/LV治疗的患者取得了较好的DFS(p=0.18)。在MSI低频/稳定的肿瘤中，加或不加伊立替康治疗患者的DFS没有差异(p=0.39)。