与试管中可伸展的“自由”DNA不同,细胞内的DNA被紧紧缠绕在名为组蛋白的蛋白质周围,形成核小体核心颗粒(NCP)。这种包裹方式让大量的DNA能挤进细胞核狭小的空间,并同时拥有调控其他物质进入DNA的功能。在部分小分子中,这种包裹方式阻止了其他物质进入其中的DNA。
自然界中的两种物质Duocarmycin SA 和yatakemycin具有抗肿瘤活性的能力,因为它们能修饰DNA。尽管科学家们知道这些小分子在活体内能行使功能,但他们还不清楚这些分子在细胞内DNA上的作用位点。Dale Boger和同事的研究发现:这些自然物质在自由DNA和NCP中的DNA上的作用是以相同的速度和序列参数进行的。这一结果显示:包裹于细胞核中的DNA的移动性让小分子得以进入塞得紧紧的空间。
新信息为精确地认识这些化合物在活体中对付肿瘤机制至关重要,也有助于设计更具威力的抗癌症化合物。